La chose est tout à fait faisable (et pas forcément une mauvaise idée, quoiqu’on en pense à titre personnel), mais va requérir quelques manipulations pour être faite correctement.
 
1. PC éteint, brancher le disque appelé à contenir Ubuntu.
 
2. Allume le PC, va dans le BIOS ou l’UEFI et fais en sorte que l’ordre de démarrage soit le suivant :

• Disque d’installation Ubuntu
• Disque où sera installé Ubuntu
• Disque contenant Windows

3. Enregistre les changements, quitte le BIOS (ça redémarrera le PC) et lance le programme d’installation d’Ubuntu.
 
4. Quand il sera question de choisir le disque contenant Ubuntu, repère bien quels /dev/sd× concernent le disque Windows et le futur disque Ubuntu : l’idée est de ne jamais toucher au contenu du disque Windows, même pour installer GRUB (tu comprendras pourquoi après). Admettons que Windows soit sur /dev/sda : il faudra faire un partitionnement manuel sur /dev/sdb, et installer aussi GRUB sur /dev/sdb (pour pas qu’il écrase le programme d’amorçage de Windows).
 
5. Une fois l’installation terminée, comme c’est le disque qui contient Ubuntu qui est amorcé en premier, tu auras le choix de démarrer soit Ubuntu, soit Windows.
 
Maintenant, supposons que tu ne veuilles plus d’Ubuntu, ou que tu débranches son disque. Que se passera-t-il ? Eh bien, tout simplement, le PC démarrera sur le disque Windows qui, demeuré intact, ne se sera même pas aperçu que tu avais installé un autre système en parallèle : tu retrouveras ton PC comme avant, en somme. Et quand tu rebrancheras le disque Ubuntu, le PC redémarrera sur GRUB. Pas mal, non ?
 
C’est un petit peu compliqué sur le moment (surtout quand on n’est pas trop expérimenté dans ce genre de bidouille), mais là, si tu fais attention à ne pas toucher au disque Windows, tu peux installer deux systèmes en parallèle, chacun sur son disque, et de manière totalement étanche l’un par rapport à l’autre.