je dirais pureftpd
 
libre et gratuit, pas de problème...
sécurisé, aussi
 
niveau ressources, on l'a utilisé voici quelques années sur un P3 633 avec 128 de RAM pour faire un serveur de fichier dans la résidence estudiantine de ma fac, sans problème, la limite était surtout au niveau des accès disque (si plusieurs users uploadent et downloadent en même temps).
 
il y avait des interface graphiques je crois, mais jamais utilisé...
par contre il peut utiliser une DB type MySQL pour gérer les utilisateurs, notamment du point de vue quotas et vitesses, de manière individuelle. et ça te permettrait de développer facilement une ptite interface web/php pour gérer les utilisateurs