Sur une machine n'utilisant ni LVM ni IDE, l'utilisation d'un noyau custom sans leur support d'actf ne m'a jamais causé le moindre souci.
Voilà, tu viens de voir un témoignage avec une expérience contraire.    
 
Tu peux adapter un noyau _exactement_ à tes besoins/usages.
Après, avec un noyau sur-mesure et trop peu générique, tu cours le risque potentiel de ne plus pouvoir booter ton système à partir du moment où un élément de ta config matérielle change.