Ton problème ne vient surement pas de ton scanner (les auteur de bd font scanner a 1200 dpi de base, le travail final s'effectue en 300, étape de réechantillonage qui n'est pas obligatoire pour toi, de plus travailler sur une planche a >600 dpi a un très gros risque de faire ramer ta becane, et d'augmenter le pas de tes brosses) a part sur le calibrage des blancs, il doit avoir une fonction avancée, ou tu peux regler la balance des blancs.
 
Pour ce qui est de la correction des courbes et autres, fait le sur photoshop, on va surement te dire que un docuement bien scanné est mieux que qu'un doc mal scanné repris sur photoshop mais ce n'est pas vrai pour le particulier.
 
Pour ton problème de trait qui apparait éméché sous photoshop c'est assez normal, les bic on une application de l'encre très variable et occasionnent de nombreux defauts, quelque soit le resultat que tu perçoit a l'oeuil sur ta feuille.
 
les auteurs de bd utilisent souvent de véritable rotrings (stylo tubulaire, rotring étant en fait une marque,  d'autre sont valable, rotring etant une référence pour beaucoups.) , les rotrings sont des stylo a encre noir très couvrante, délivré par une pointe qui garantie un debit constant.
 
par exemple tu a des rotring 0.1  0.3 etc. Ces stylos sont très cher, fragiles, et demandent une utilisation par une main entrainée, douce et souple, sans compter un entretien régulier, mais le resultat est magnifique, voir parfait si tu les maitrises. Certains te diront que c'est pour le dessin technique, mais ils sont très utilisés par les artistes de même. Si tu inclus des variation de graisses dans ton trait, pense a la plume, encre de chine plume peuvent donner un très bon resultat si ton papier a un grain sufisament leger pour ne pas accrocher la pointe, ce qui provoquerait de petites peluches.
 
pense au papier rough, c'est un papier qui est lisse, froid, et permet le depot d'encre comme les pentones, et meme rotring, de façon très fidèle, il est relativement peu cher, et se vend en bonne quantité, sont defaut est la finesse et la transparence, n'hesite pas pour le scan a plaquer derrière 2-3 feuilles d'un beau blanc pur pour ne pas que ta lampe transperce le papier.