En fait j'ai résolu mon problème, j'ai confectionné les polices dont j'avais besoin avec FontLab, et avec une macro Word, je remplace toutes les ligatures d'un seul click. Par ailleurs j'ai fait une barre d'outils pour appliquer les styles commnement utilisés dans Latex.
 
A l'heure actuelle et à condition d'utiliser le MathType, il est impossible de distinguer les Pdfs générés avec Word et avec Latex. Si vous voulez un exemple donnez moi votre mail et je vous enverrai la preuve.
 
Pour répondre à la question pourquoi... En fait je ne suis pas débutant en Latex et pas un confirmé non plus. Partout où je vais tout le monde utilise Word. Il est très facile de travailler avec quelqu'un qui ne sait pas utiliser Latex mais sait utiliser le Word. Par ailleurs, Word offre une gestion plus souple des images (de loin) et les outils linguistiques plus intéressants. On voit ce que l'on fait directement avec Word et on galère pas pour trouver une référence que l'on a mis je ne sais où. Enfin, chez nous à l'école il y a pas de compilateurs Latex, par contre il y Word.
 
Voilà - je pense que des systèmes tels que Latex ne vont pas tarder à disparaître avec l'apparition des outils de plus en plus élaborés de PAO.
 
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Bon forum