C'est 2,5% au titre du droit de partage dû à l'Etat pour les indivisions d'origine conjugale ou successorales, et effectivement si le partage met fin à l'indivision c'est un droit du sur la totalité du bien (avant c'était 1,5%).
Pour les autres on est sur du 5;09% sur parts cédées (avec un mélange des taux si on a une reprise de passif par une partie : partage avec attribution à un des ex époux qui en "contrepartie" reprend l'emprunt immobilier à son compte, là on partage à 2,5% et 5;09% en fonction des proportions).
Sachant que 5;09% peut devenir 5,79% fonction des départements (réforme Hollande applicable à partir de mars 2014).
Il peut être avantageux de vendre la résidence principale avant et de partager les sommes amiablement (les 2,5% sont des droits lié à un acte de partage, sans acte il n'y a pas de droit). Mais pour ça il faut s'entendre tant sur le principe de la vente que sur la répartition des sommes, et faut quand même payer un avocat pour le divorce.
Bref, la séparation c'est pas avantageux financièrement, qu'on soit marié ou pas.