Mais en démarage manuel (pas d'autoboot) donc pas de problèmes de type/taille de partition

Dès que j'ai un peu de temps dispo pour une config àlamain je regarderais si ça tourne chez moi en autoboot...

Forcément si tu branches pas ton lecteur il peut pas trouver la carte
Ok  

Que Nautilus (le "gestionnaire" de fichier) ne reconnaisse pas ta carte (ou seulement une partition) c'est pas grave, mais gparted doit la voir comme un disque (ça ne marche pas si tu te sers de l'apn comme lecteur, il faut un "vrai" lecteur SD), éventuellement tu choisi "rafraichir" dans le menu de gparted

Sinon, sous windows, tu peux aussi utiliser CardTricks chargé de t'installer les deux partitions