T’auras peut-être pas à aller jusque-là : réparer GRUB (parce que Windows est un sagouin ne connaissant que lui-même et écrasant tout bootloader pour mettre le sien) suffira, je pense.
 

Au pire : désinstalle-le avant la mise à jour et réinstalle-le après. Idem pour tout ce qui est antivirus et outil système tiers.
 

Non seulement la simple mention de logiciels de Torrents est interdite ici (même si tu ne t’en servais que pour des usages légaux), mais µTorrent est malheureusement un logiciel qui installe des malwares avec lui (même si tu le récupères directement depuis le site de l’éditeur). Raison de plus pour l’éjecter.